Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA8P53708 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA8P53708 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA8P53708 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms