Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCNKBP51801 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms