Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK8P49336 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK8P49336 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK8P49336 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK8P49336 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK8P49336 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK8P49336 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK8P49336 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms