Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA4P48058 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA4P48058 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GRIA4P48058 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms