Protein–RNA interactions for Protein: P30305

CDC25B, M-phase inducer phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25BP30305 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDC25BP30305 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms