Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP1P29466 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms