Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
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