Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms