Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCP2P22307 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCP2P22307 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCP2P22307 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms