Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GM2AP17900 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GM2AP17900 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GM2AP17900 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GM2AP17900 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GM2AP17900 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms