Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRG2P13727 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRG2P13727 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms