Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXD8P13378 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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