Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYL4P12829 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYL4P12829 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYL4P12829 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYL4P12829 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYL4P12829 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYL4P12829 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYL4P12829 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms