Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SETSIPP0DME0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms