Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BP0C0L5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BP0C0L5 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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