Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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PDE6DO43924 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PDE6DO43924 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PDE6DO43924 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PDE6DO43924 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PDE6DO43924 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PDE6DO43924 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PDE6DO43924 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PDE6DO43924 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PDE6DO43924 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PDE6DO43924 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PDE6DO43924 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PDE6DO43924 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PDE6DO43924 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PDE6DO43924 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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PDE6DO43924 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PDE6DO43924 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PDE6DO43924 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PDE6DO43924 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PDE6DO43924 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PDE6DO43924 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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