Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCF2LO15068 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms