Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFAP69A5D8W1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms