Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms