Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms