Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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