Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PEF1Q9UBV8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEF1Q9UBV8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms