Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CCDC88CQ9P219 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms