Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CALCOCO1Q9P1Z2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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