Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCC13Q9NSE7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABCC13Q9NSE7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms