Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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