Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGIP1Q9BQI5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms