Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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NIPSNAP1Q9BPW8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NIPSNAP1Q9BPW8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NIPSNAP1Q9BPW8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NIPSNAP1Q9BPW8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NIPSNAP1Q9BPW8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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