Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHFRQ96EP1 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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