Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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