Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP50Q70EL3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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