Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms