Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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