Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CXCL17Q6UXB2 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CXCL17Q6UXB2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL17Q6UXB2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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