Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FAM208BQ5VWN6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM208BQ5VWN6 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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