Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DCAF6Q58WW2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms