Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 OR2Z1-202ENST00000641125 1755 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SEZ6L2-202ENST00000346932 3015 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GUCD1-213ENST00000621833 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GRID1-AS1-203ENST00000630182 2100 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-203ENST00000351936 2478 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 XIAPP2-201ENST00000527404 1852 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SIDT2-220ENST00000628876 2609 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms