Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC96Q2M329 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC96Q2M329 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms