Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDB1Q16531 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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