Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms