Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC85BQ15834 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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