Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIP4Q15650 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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