Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NCAPHQ15003 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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