Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms