Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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