Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FAM53BQ14153 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms