Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COL4A6Q14031 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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COL4A6Q14031 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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