Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FHL3Q13643 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FHL3Q13643 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms