Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CUL3Q13618 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CUL3Q13618 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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