Protein–RNA interactions for Protein: Q13480

GAB1, GRB2-associated-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB1Q13480 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GAB1Q13480 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms